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分子动力学入门秘籍

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发表于 2019-12-1 21:35:01 | 显示全部楼层 |阅读模式
分子动力学计算的尺度是原子级别的,可以计算材料的一些微观性质。很多想学习分子动力学的人,都感觉这是一个很难的事。其实这个计算比那个没有想象中的那么难。我下面介绍下快速入门分子动力学的学习步骤:

1. 找一本介绍分子动力学原理的书看下,书越薄越简单越好,最好一下能看懂的那种。另外找3-5份做分子动力学的博士论文看下,只看原理介绍部分。这样你就对分子动力学的原理有了基本的认识。
2. 接下来学习软件命令,看手册。软件都有自带的例子,把例子拿来对着手册翻翻,看看每个命令是什么意思。在例子中出现频率最高的就是常用命令,一定要对照手册吃透。接下来,快速的把所有指令都看一遍,不求记住,只求看懂有个大概印象。

3. 接下来就要在网上找几个例子,先跑起来体验下。体验完之后,就要琢磨手册中的例子,试着跑上几个。然后,就是看文献,把跟自己关系最大的文献看明白,重复文献中的结果。边跑文献中的结果,就开始琢磨自己的课题,考虑怎么把自己要计算的内容实现。

4. 结果后处理,脚本尽量从网上下载,把网上下来的脚本研究下,适当改改就可以用了。

5. 等你把结果做出来就开始写论文了,等一篇论文出来,你基本就很熟悉分子动力学是咋回事了。以后有时间就可以慢慢深入,更细致的了解原理,并不断提高自身的技术。等到非常熟悉有余力以后,就可以琢磨算法了。

分子动力学除了用来计算材料的微观性质,你还可以以分子动力学算法为研究对象,优化算法。同时还可考虑将分子动力学与第一性原理、人工智能算法结合起来,做出多领域融合的结果。这些对入门者来说有点距离,但只要有想法,好好努力迟早都能实现。



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